在企业的经营模式中，总分机构模式是常见的一种：总公司设立多个分支机构，总公司负责整体战略、核心业务和重大决策，分支机构负责特定地区或市场的业务活动。
在企业的经营模式中，总分机构模式是常见的一种：总公司设立多个分支机构，总公司负责整体战略、核心业务和重大决策，分支机构负责特定地区或市场的业务活动。总分机构模式有助于企业有效地扩大业务范围，提高市场响应速度，增强竞争力。然而，在总分机构模式下，部分企业未能准确把握增值税即征即退等税收优惠政策的适用条件，未对优惠项目进行单独、准确核算，导致产生税务风险。
典型案例
位于X省的M新能源发展有限公司从事新能源发电及电力供应，经营项目主要为风力发电项目。M公司总部负责整体战略，设立多个分支机构负责X省各地市的风力发电项目。税务部门在对M公司进行风险管理过程中发现，M公司总部于2024年底申请增值税留抵退税2311.63万元，但其增值税申报收入极少。进一步分析企业申报和发票信息，税务部门发现M公司增值税由分支机构在生产经营地独立纳税，2024年按照项目核算，享受了增值税即征即退优惠。
通过数据比对以及约谈M公司财务人员，税务部门发现M公司总部增值税进项税额主要源于风力发电机组、建筑安装等项目的建设支出，但总部无实体发电项目，未产生对应销项。M公司分支机构在生产经营地独立纳税，但受M公司统一采购影响，将前期费用归集到总部，存在成本费用归属与优惠主体不匹配的税务风险。
成本费用归属与享惠主体不匹配
享受增值税即征即退优惠的前提，是对优惠项目进行单独、准确的核算。这一要求在总分机构模式下尤为关键，也最容易被忽视。
在现行政策下，企业享受新能源发电项目增值税优惠，应依据批准日期和项目类型分情况适用税收政策。就风电项目而言，根据《财政部 海关总署 税务总局关于调整风力发电等增值税政策的公告》（财政部 海关总署 税务总局公告2025年第10号）规定，原陆上风电增值税即征即退50%政策执行至2025年10月31日；自2025年11月1日—2027年12月31日，对纳税人销售自产的利用海上风力生产的电力产品，实行增值税即征即退50%的政策。
因此，M公司能否适用即征即退优惠，须依据其项目类型和建成投产时间严格判定。企业2024年销售自产的利用风力生产的电力产品等，可按照政策规定，适用增值税即征即退50%的政策。自2025年11月1日起，企业仅销售自产的利用海上风力生产的电力产品，可按照政策规定适用增值税即征即退50%的政策。
《财政部 税务总局关于出口业务增值税和消费税政策的公告》（财政部 税务总局公告2026年第11号）明确，纳税人应当分别核算增值税免抵退项目和增值税即征即退、先征后返（退）项目，并分别申请适用增值税免抵退税和即征即退、先征后返（退）政策。也就是说，对于M公司分支机构符合条件的风力发电项目，企业必须对项目的进项税额进行单独核算，才可以享受增值税即征即退50%的税收优惠。
案例中，M公司分支机构的风力发电机组、建筑安装等前期建设支出的进项发票，因统一采购并集中开具发票至M公司总部，未随业务实质开具至对应的分支机构，导致进项税额的归属与实际经营主体严重脱节，风电项目进项税额未单独核算，分支机构错误享受了增值税即征即退优惠。同时，M公司总部无对应销项，导致其存在大量留抵税额，取得2311.63万元留抵退税。总部与分支机构因进项错配，造成总部错误享受了增值税留抵退税优惠。
税务部门对M公司财务人员进行政策辅导，告知其增值税即征即退项目的进项税额应单独核算，不得归集至总部。M公司总部调整费用后，按照《国家税务总局关于办理增值税期末留抵退税有关征管事项的公告》（国家税务总局公告2025年第20号）规定，通过电子税务局提交《缴回留抵退税申请表》，于2025年11月缴回不符合规定的留抵退税2311.63万元，并优化内部费用分摊机制。
建议企业合规核算收入和成本
今年1月1日起，增值税法及其实施条例施行，企业需要注意增值税法有关征管要求，在日常申报中确保核算合规、分录准确，避免在政策衔接期存在理解偏差，导致产生税务风险。根据《财政部 税务总局关于增值税法施行后增值税优惠政策衔接事项的公告》（财政部 税务总局公告2026年第10号）规定，对纳税人销售自产的利用海上风力生产的电力产品，实行增值税即征即退50%的政策，继续执行。
笔者提醒，享受优惠的风力发电项目，须与其他非优惠项目分别核算收入和成本，并对管理费用、财务费用等期间费用按照合理标准进行分摊。若费用归集与财务核算混乱，企业不仅面临优惠资格丧失的风险，还可能因成本费用核算不准确，导致各项目应纳税所得额失真。
企业在取得进项发票时，应按照受益项目和受益主体进行归属认定，确保进项税额跟着业务走、票据跟着项目走。建议企业从项目立项阶段建立独立的财务核算体系，按项目确认收入、归集成本、分摊费用。同时，定期对各项目核算的准确性开展内部审查，重点核实进项税额归属是否与业务实质一致、期间费用分摊是否有据可依，做到账证相符、账实相符。
（作者单位：国家税务总局郑州航空港经济综合实验区税务局）
相关推荐
-
-
把好税务合规关口 夯实企业发展根基
伴随税收治理环境持续演变，税务合规的价值内涵应不断拓展，逐步由侧重风险防范的基础管理事项，转变为企业现代化治理的关键组成部分；税法遵从也应在守住合规底线的基础上，逐步成为企业主动锻造的核心竞争力。
-
将行政执法监督嵌入税费治理流程
自2026年2月《行政执法监督条例》正式施行以来，该局研究制定贯彻落实《条例》工作实施方案，将《条例》关于健全执法监督机制、强化重点领域监督、严格执法责任追究、加强监督贯通协同等方面的要求，细化为6大类22项任务56个具体举措，持续加强和规范执法监督。
-
行政行为被撤销，行政复议是否还要继续？
在税务行政复议实践中，有时会出现这种情形：纳税人因不服税务机关作出的税务处理等决定申请行政复议，复议期间，作为被申请人的税务机关自查发现问题，主动撤销了原行政行为。
-
-
落实新复议制度，实质性化解税务行政争议
自2026年7月1日起施行的行政复议法实施条例（以下简称《条例》）进一步细化自我纠正、调解、释法说理、多元审理等制度，确立了行政复议实质性化解行政争议的目标，为税务行政复议提供了更有效的制度标尺。
